RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586302.5

RFX2-204, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 4

Gene RFX2, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-204	ENST00000586302	SMPD2	O60906	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	IMPDH2	P12268	514 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	PRG2	P13727	222 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	NTF4	P34130	210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	NR1H2	P55055	460 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	PDK3	Q15120	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	ROS1	P08922	2347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	ACAN	P16112	2415 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	MTOR	P42345	2549 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RFX2-204	ENST00000586302	DSCAM	O60469	2012 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	DNPH1	O43598	174 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	THBS1	P07996	1170 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	CXCR1	P25024	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SLC35A1	P78382	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	H3F3A	P84243	136 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	STK11	Q15831	433 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	AGK	Q53H12	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	FRS3	O43559	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	BMP2	P12643	396 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SLC16A1	P53985	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	COPZ1	P61923	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	BNIP2	Q12982	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	FADD	Q13158	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	IFT52	Q9Y366	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	GPR171	O14626	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	CLOCK	O15516	846 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	PGM3	O95394	542 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	COX5A	P20674	150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	IDUA	P35475	653 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	ATP4B	P51164	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	MAP2K6	P52564	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	HOXC5	Q00444	222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SQLE	Q14534	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	OR7A5	Q15622	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302		Q5PR19	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RFX2-204	ENST00000586302	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms