RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SDHAF3Q9NRP4 125 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKUB1A6NFN9 424 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PEPDP12955 493 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 HK1P19367 917 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTR3AP46098 478 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAS1P54826 345 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 EGR4Q05215 589 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 SSPNQ14714 243 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRINAQ7Z429 371 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPOQ8IVL8 374 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ESX1Q8N693 406 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 LGALS12Q96DT0 336 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRRX2Q99811 253 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIIAD1A6NNX1 92 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf51A8MQB3 221 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATE1O95260 518 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP1R3DO95685 299 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADRA2AP08913 450 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTR1FP30939 366 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCF15Q12870 199 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 LSAMPQ13449 338 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 P2RY8Q86VZ1 359 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC17Q8N6Y2 441 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 RACGAP1Q9H0H5 632 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLRF1Q9NZS2 232 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0R082 166 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 DKK1O94907 266 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABARAPO95166 117 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFNGP01579 166 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 MSX1P28360 303 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOS3P29474 1203 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPS15P62841 145 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 C3orf38Q5JPI3 329 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 MND1Q9BWT6 205 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 NANSQ9NR45 359 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R16Q9NYV7 291 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FRYLO94915 3013 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRN3E7EW58 273 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF3P17036 446 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf53Q8N6V4 93 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST8SIA1Q92185 356 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 NACC2Q96BF6 587 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAPBPLQ9BX59 468 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPEGQ15772 3267 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TP53I11O14683 189 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGA10O75578 1167 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A12O75746 678 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ICAM2P13598 275 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD36P16671 472 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLBD1Q6P4A8 553 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 OPN5Q6U736 354 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PROKR2Q8NFJ6 384 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL7AQ9H8H3 244 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF160Q9HCG1 818 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRNA9Q9UGM1 479 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL21Q9UJP4 597 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYL12AP19105 171 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TGFBR2P37173 567 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMED1Q13445 227 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED22Q15528 200 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARMC4Q5T2S8 1044 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 NANOGP1Q8N7R0 232 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10G3Q8NGC4 313 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXJ2Q9P0K8 574 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIF3AQ9Y2N7 669 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMED7Q9Y3B3 224 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa26.46■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ASAH2BP0C7U1 165 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TGM1P22735 817 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPL4P36578 427 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARMCX4Q5H9R4 360 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf46Q6UWT4 87 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS33Q8NF86 280 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM117AQ9C073 453 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDEL1Q9GZM8 345 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FKRPQ9H9S5 495 aa26.46■■□□□ 1.83
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