RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CCDC154A6NI56 674 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TM9SF1O15321 606 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SSX4O60224 188 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PTAFRP25105 342 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CD40P25942 277 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 MAGEA8P43361 318 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 HTR3AP46098 478 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 H3F3AP84243 136 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 NRF1Q16656 503 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 INPP5KQ9BT40 448 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 MALT1Q9UDY8 824 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM72A0PK05 275 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 AGAP5A6NIR3 686 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 M0R1B8 84 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CD5LO43866 347 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CHRM4P08173 479 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ITGA5P08648 1049 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 IMPDH2P12268 514 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TACR3P29371 465 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC35A1P78382 337 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 STX3Q13277 289 aa14.87□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 OGFOD2Q6N063 350 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CASP12Q6UXS9 341 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.87□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF208O43345 1280 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 GSNP06396 782 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 IL7RP16871 459 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 IL12AP29459 219 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CDKN2CP42773 168 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 NUDT6P53370 316 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 BST1Q10588 318 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 MUC15Q8N387 334 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 WDR31Q8NA23 367 aa14.86□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PMM1Q92871 262 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 OR52E6Q96RD3 313 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.86□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 AIG1Q9NVV5 245 aa14.86□□□□□ -0.03
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HERC3-211ENST00000513325 UPB1Q9UBR1 384 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ABCA1O95477 2261 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CFAP73A6NFT4 308 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SDHDO14521 159 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 GPRIN2O60269 458 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PGRP06401 933 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 NR2F1P10589 423 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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