RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	PEX11A	O75192	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	UGT2B17	O75795	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MPIG6B	O95866	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CD8A	P01732	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TUBB	P07437	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ALOX5	P09917	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ENPP1	P22413	925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ELK4	P28324	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IL12A	P29459	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SFTPD	P35247	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PGM1	P36871	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CDKN2C	P42773	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MVD	P53602	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NR1H2	P55055	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CASP9	P55211	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NAA20	P61599	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TAB1	Q15750	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF141	Q15928	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SDF2	Q99470	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCL19	Q99731	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ABCA1	O95477	2261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PDLIM1	O00151	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SDHD	O14521	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF195	O14628	629 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HS3ST1	O14792	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CRCP	O75575	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CHRM4	P08173	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FCGR2A	P12318	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LCN1	P31025	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GCK	P35557	465 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HPCAL1	P37235	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ASMT	P46597	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR3A2	P47893	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCT5	P48643	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	P2RX1	P51575	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ATP12A	P54707	1039 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CLDN8	P56748	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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