RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 FSHBP01225 129 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ALOX5P09917 674 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT4P19013 534 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 CTNNA2P26232 953 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 IMPA1P29218 277 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 AGTR1P30556 359 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 NR2C2P49116 596 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 TTPAP49638 278 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 KLK7P49862 253 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 PPOXP50336 477 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF83P51522 516 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP10-3P60369 221 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 MORF4L2Q15014 288 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 RRM2BQ7LG56 351 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SZRD1Q7Z422 152 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 TDRPQ86YL5 185 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM10Q96HG1 83 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 B9D2Q9BPU9 175 aa3.45□□□□□ -1.86
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ECHDC1-211ENST00000460558 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1456Q9P272 454 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.45□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0G2JN53 185 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5H1A6NKK0 313 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 C4orf51C9J302 202 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 K7EIL1 84 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 M0R1B8 84 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 AP3D1O14617 1153 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB14O43829 449 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ZIC3O60481 467 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 LYZL6O75951 148 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPAN9O75954 239 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 CLPXO76031 633 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 MPZL1O95297 269 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SYNGR4O95473 234 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN9O95484 217 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.863e-6■□□□□ 11
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINA6P08185 405 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 NAGAP17050 411 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 GGT1P19440 569 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMA3P25788 255 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMB4P28070 264 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC6A8P48029 635 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 LIM2P55344 173 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN20P56880 219 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 HERVK_113P63132 956 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVK-8P63133 956 aa3.44□□□□□ -1.86
ECHDC1-211ENST00000460558 PRAMEP78395 509 aa3.44□□□□□ -1.86
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