RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU4F3Q15319 338 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFKFB4Q16877 469 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM69Q5SWH9 247 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CES4AQ5XG92 561 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4C11Q6IEV9 310 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MZT2BQ6NZ67 158 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OPN5Q6U736 354 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COLCA1Q6ZS62 124 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DYMQ7RTS9 669 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIGWQ7Z7B1 504 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LONP2Q86WA8 852 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GBGT1Q8N5D6 347 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD42Q8N9B4 389 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KYQ8NBH2 561 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR9A4Q8NGU2 314 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXD1Q8NHP7 514 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP7Q93009 1102 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR10C1Q96KK4 312 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HRASLS5Q96KN8 279 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPATA32Q96LK8 384 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC22A12Q96S37 553 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAD1Q99259 594 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR15LQ9BU68 103 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NMUR2Q9GZQ4 415 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMG20AQ9NP66 347 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DECR2Q9NUI1 292 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEPT10Q9P0V9 454 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRP2BPQ9P2M1 347 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PISDQ9UG56 409 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR45Q9Y484 360 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YIPF1Q9Y548 306 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPHP3Q7Z494 1330 aa-4.21□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD163L1Q9NR16 1453 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RTL9Q8NET4 1388 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PI4KAP2A4QPH2 592 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA8CPA6NN73 597 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF815PA8K554 130 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 G3V3G9 751 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VWA5AO00534 786 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MGST3O14880 152 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KMOO15229 486 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PALMO75781 387 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AP1G2O75843 785 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNTN5O94779 1100 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFNA4P05014 189 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFNA16P05015 189 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SBK2P0C263 348 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MX2P20592 715 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL3RAP26951 378 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACSL1P33121 698 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MC3RP41968 323 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSSP48637 474 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDH4P55283 916 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFAIP2Q03169 654 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ECH1Q13011 328 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFAP5Q13361 173 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DSG2Q14126 1118 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAA25Q14CX7 972 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYCP1Q15431 976 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KYNUQ16719 465 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERMARDQ5T6L9 678 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSPO2Q5TGU0 170 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SULT1C3Q6IMI6 304 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNV1Q6PIU1 500 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCTLQ6UWM7 567 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF165Q6ZSG1 346 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00346Q8IVM7 164 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM48Q8IWZ4 208 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF654Q8IZM8 581 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHDC1Q8N7A1 406 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RCBTB1Q8NDN9 531 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR14L1PQ8NHC6 308 aa-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP-4.22□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC38A5Q8WUX1 472 aa-4.22□□□□□ -3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms