RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT14O95848 222 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PGCP20142 388 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DLSTP36957 453 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LTBQ06643 244 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MISPQ8IVT2 679 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LNX2Q8N448 690 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SGTBQ96EQ0 304 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf10Q9HB07 376 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP250Q9BV73 2442 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM186AA6NE01 2351 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TM4SF5O14894 197 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RCBTB2O95199 551 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP3P42574 277 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF91Q05481 1191 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 UTS2BQ765I0 119 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 Q96MT0 163 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MED11Q9P086 117 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HCN1O60741 890 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IGF2P01344 180 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF24P17028 368 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 BMP7P18075 431 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF74Q16587 644 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GXYLT1Q4G148 440 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf183Q5T699 404 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR87Q9BY21 358 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C21orf140B9A014 251 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD1O60671 282 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR7A10O76100 309 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNA2P20248 432 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DOC2BQ14184 412 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IRF3Q14653 427 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ARSKQ6UWY0 536 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RTL4Q6ZR62 310 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPHQ8WWY8 451 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MYDGFQ969H8 173 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NACC2Q96BF6 587 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HPP00738 406 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LCKP06239 509 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LIMK1P53667 647 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MLF1P58340 268 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXK2Q01167 660 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TAAR8Q969N4 342 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IFT27Q9BW83 186 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MED17Q9NVC6 651 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IL17BQ9UHF5 180 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM183AA6NL82 134 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MCIDASD6RGH6 385 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 STMND1H3BQB6 276 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms