RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71CQ8NEG0 241 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 APOPT1Q96IL0 206 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB6Q9NWX5 421 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM160Q9NX00 188 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MKS1Q9NXB0 559 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MALT1Q9UDY8 824 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DUXAA6NLW8 204 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA5P08648 1049 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PGM1P36871 562 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRA6Q16445 453 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM168AQ92567 244 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35G5Q96KT7 338 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MUS81Q96NY9 551 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5KQ9BT40 448 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA9Q9UGM1 479 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2P2O95744 297 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 G6PDP11413 515 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF544Q6NX49 715 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC103Q8IW40 242 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR31Q8NA23 367 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52E4Q8NGH9 312 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGXQ8TBF5 258 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf105Q8TEF2 133 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 BEX2Q9BXY8 128 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51I1Q9H343 314 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0513O60268 411 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6HO94772 140 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A1P53985 500 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAURQ03405 335 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PGS1Q32NB8 556 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf62Q7Z3J2 963 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF563Q8TA94 476 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PDLIM1O00151 329 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR171O14626 319 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RYKP34925 604 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A3Q00325 362 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf135Q5VTT2 229 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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CAPNS1-211ENST00000590874 HMGN2P46Q86SG4 172 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN8P56748 225 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT5Q11128 374 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7E24Q6IFN5 339 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 EMBQ6PCB8 327 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP12Q6UXS9 341 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG3Q86Y34 549 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB8BQ92930 207 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 EXD2Q9NVH0 621 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR45Q9Y484 360 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD28O15084 1053 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 DNPH1O43598 174 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR12D1P0DN82 309 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNA2P20248 432 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 USF1P22415 310 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNA4P52798 201 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2B6P58173 313 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 PROX1Q92786 737 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ZG16BQ96DA0 208 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SHARPINQ9H0F6 387 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TLDC2A0PJX2 215 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN24A6NM45 220 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG7O75391 227 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA8P43361 318 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 H3F3AP84243 136 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 XAGE5Q8WWM1 108 aa22.46■■□□□ 1.19
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