RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 OR10H2O60403 315 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 UBXN7O94888 489 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SCG5P05408 212 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LIPCP11150 499 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPNP16150 400 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MYL12AP19105 171 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 UGT2B10P36537 528 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IFNGR2P38484 337 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OMPP47874 163 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PPP5CP53041 499 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DAB2P98082 770 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TLE3Q04726 772 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN31Q12999 210 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CEBPEQ15744 281 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 USP53Q70EK8 1073 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OOSP2Q86WS3 158 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GRHL3Q8TE85 626 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ART5Q96L15 291 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SAMD8Q96LT4 415 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 WACQ9BTA9 647 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MND1Q9BWT6 205 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GLTPQ9NZD2 209 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPACA6W5XKT8 324 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A0J9YY10 115 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A0X1KG70 313 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TOR1AO14656 332 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPR75O95800 540 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN19P0C672 248 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GLB1P16278 677 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GSTM3P21266 225 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRKAR1BP31321 381 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SOX6P35712 828 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OCLNQ16625 522 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DCST2Q5T1A1 773 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C22orf42Q6IC83 251 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FBXW5Q969U6 566 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MED20Q9H944 212 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CACNA1CQ13936 2221 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HRKO00198 91 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GDF9O60383 454 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RAB36O95755 333 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MT-CO3P00414 261 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MTNR1AP48039 350 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARFIP1P53367 373 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A1P53985 500 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDH11P55287 796 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CD83Q01151 205 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CLN3Q13286 438 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BTN1A1Q13410 526 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STEAP3Q658P3 488 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SYT14Q8NB59 555 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PFN4Q8NHR9 129 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM163Q8TC26 289 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TM9SF4Q92544 642 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PEX11GQ96HA9 241 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TBX5Q99593 518 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PIGUQ9H490 435 aa6.46□□□□□ -1.38
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