RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ACER3Q9NUN7 267 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.54□□□□□ -0.08
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VARS-216ENST00000428445 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.54□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.54□□□□□ -0.08
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VARS-216ENST00000428445 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.52□□□□□ -0.09
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VARS-216ENST00000428445 AP3D1O14617 1153 aa14.51□□□□□ -0.09
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VARS-216ENST00000428445 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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VARS-216ENST00000428445 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.51□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.51□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 ELOA3Q8NG57 546 aa14.51□□□□□ -0.09
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VARS-216ENST00000428445 FAM168AQ92567 244 aa14.51□□□□□ -0.09
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VARS-216ENST00000428445 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.51□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 KIAA0513O60268 411 aa14.5□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 PMS2P2O95744 297 aa14.5□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 IMPDH2P12268 514 aa14.5□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VARS-216ENST00000428445 VLDLRP98155 873 aa14.5□□□□□ -0.09
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