RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 DOCK2Q92608 1830 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 HCRTR1O43613 425 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CR2P20023 1033 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 GPR39O43194 453 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM221A6NGB7 291 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ALOX12BO75342 701 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MAS1P04201 325 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CD79AP11912 226 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GPR3P46089 330 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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