RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 FAM209BQ5JX69 171 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HSDL2Q6YN16 418 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ABHD13Q7L211 337 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ATCAYQ86WG3 371 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PIGXQ8TBF5 258 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NT5CQ8TCD5 201 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MARC2Q969Z3 335 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SDF2Q99470 211 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MMP27Q9H306 513 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CALML5Q9NZT1 146 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RAB19A4D1S5 217 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 H3BMH7 237 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KCNK2O95069 426 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PDGFAP04085 211 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 YES1P07947 543 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MAOBP27338 520 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CD40LGP29965 261 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DEFA1P59665 94 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DEFA3P59666 94 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HHEXQ03014 270 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NNATQ16517 81 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A45Q8N413 288 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 COX18Q8N8Q8 333 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RNF31Q96EP0 1072 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ASPNQ9BXN1 380 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GHITMQ9H3K2 345 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDC42EP2O14613 210 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLITRK5O94991 958 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DDAH2O95865 285 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G2AP14555 144 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GABRA3P34903 492 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1E1P36543 226 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CD79BP40259 229 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDK5Q00535 292 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NCF4Q15080 339 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NDUFA9Q16795 377 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LINC00303Q3SY05 128 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AGAP6Q5VW22 663 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZAR1Q86SH2 424 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR2L13Q8N349 312 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PHF21AQ96BD5 680 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RNFT2Q96EX2 444 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SMIM10Q96HG1 83 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AGAP4Q96P64 663 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARHGDIGQ99819 225 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AGAP5A6NIR3 686 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SYT5O00445 386 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GNB5O14775 395 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SHOXO15266 292 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SSX5O60225 188 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms