RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398		Q6ZSR3	168 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR6V1	Q8N148	313 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MFSD4A	Q8N468	514 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM199	Q8N511	208 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MRAP	Q8TCY5	172 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CD200R1	Q8TD46	325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ASB10	Q8WXI3	467 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BAALC	Q8WXS3	180 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TFAP2B	Q92481	460 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAF2	Q96CS3	445 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NXPE2	Q96DL1	559 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	VSTM2L	Q96N03	204 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GGACT	Q9BVM4	153 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	AMN	Q9BXJ7	453 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NT5DC2	Q9H857	520 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ARL15	Q9NXU5	204 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	VNN3	Q9NY84	501 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	USP22	Q9UPT9	525 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZMYM6	O95789	1325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PR48	441 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NEMP2	A6NFY4	417 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BTN3A3	O00478	584 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CHST1	O43916	411 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RAD1	O60671	282 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC19A2	O60779	497 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NFATC1	O95644	943 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NR3C1	P04150	777 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TSPAN8	P19075	237 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BMP5	P22003	454 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HTR2C	P28335	458 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NMBR	P28336	390 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SSTR5	P35346	364 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NBL1	P41271	181 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TNFSF10	P50591	281 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NUDT6	P53370	316 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CLDN12	P56749	244 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CLDN18	P56856	261 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJB13	P59910	316 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FKBP1B	P68106	108 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC25A3	Q00325	362 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CDR2	Q01850	454 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FPGS	Q05932	587 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BAMBI	Q13145	260 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ITGA9	Q13797	1035 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DOC2B	Q14184	412 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SYPL1	Q16563	259 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PGGHG	Q32M88	737 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ESCO2	Q56NI9	601 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM225	Q6GV28	225 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PARG	Q86W56	976 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		2.94	□□□□□ -1.94

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