RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 TIMP4Q99727 224 aa22.03■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 FOXQ1Q9C009 403 aa22.03■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 CD8B2A6NJW9 211 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 C17orf105B2RV13 164 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 CD8BP10966 210 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 CAV3P56539 151 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 KCNAB1Q14722 419 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 SGTBQ96EQ0 304 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 ART5Q96L15 291 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 ADGRL4Q9HBW9 690 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 SNPHO15079 494 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 CLUP10909 449 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 BIKQ13323 160 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 INSL4Q14641 139 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 TXNDC15Q96J42 360 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 CUTCQ9NTM9 273 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.02■■□□□ 1.12
TRIM54-201ENST00000296098 NDUFB2O95178 105 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MT-ND5P03915 603 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SBK2P0C263 348 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 IL7P13232 177 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PPP3R1P63098 170 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 BAK1Q16611 211 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 XKRXQ6PP77 449 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF440Q8IYI8 595 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SLC2A12Q8TD20 617 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 NDC1Q9BTX1 674 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 LANCL2Q9NS86 450 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 A0A087WUJ7 227 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 FABP12A6NFH5 140 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SSX4O60224 188 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 POU4F2Q12837 409 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM91Q6ZNR0 172 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 LRFN5Q96NI6 719 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TIGARQ9NQ88 270 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 HAO2Q9NYQ3 351 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC85CA6NKD9 419 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM150CB9EJG8 249 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR2B3O76000 313 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ACTC1P68032 377 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ACTA1P68133 377 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL26Q53HC5 615 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR5M3Q8NGP4 307 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SMPDL3BQ92485 455 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 LMF1Q96S06 567 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CHRNA9Q9UGM1 479 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SHISA3A0PJX4 238 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PPM1BO75688 479 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MED25Q71SY5 747 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR5W2Q8NH69 310 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 COMMD3Q9UBI1 195 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PQ09 198 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PIAS2O75928 621 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 NCR1O76036 304 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 GYPBP06028 91 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 GDPD1Q8N9F7 314 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF527Q8NB42 609 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 FAM71CQ8NEG0 241 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 C3orf49Q96BT1 292 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ATF6BQ99941 703 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SACM1LQ9NTJ5 587 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms