RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 IDUAP35475 653 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GJA5P36382 358 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PELI3Q8N2H9 469 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ELP4Q96EB1 424 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NICN1Q9BSH3 213 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 HINT2Q9BX68 163 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 EGLN3Q9H6Z9 239 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 STARD5Q9NSY2 213 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 METTL15A6NJ78 407 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ACPPP15309 386 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD12P35452 270 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MMP12P39900 470 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM185AQ8NFB2 350 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A12Q8NGT7 310 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R35Q8TAP8 253 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RAB9BQ9NP90 201 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK5O95279 499 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SCG5P05408 212 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LTBQ06643 244 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NFATC4Q14934 902 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2A1Q16548 175 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA3Q9HB20 300 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 POLHQ9Y253 713 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3BQ13214 749 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RPE65Q16518 533 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR1J4Q8NGS1 313 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FGF13Q92913 245 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG3O60359 315 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FURINP09958 794 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 EVI2BP34910 448 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A3P43003 542 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NIPAL3Q6P499 406 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SGCZQ96LD1 299 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CTHP32929 405 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2NLQ5JXB2 153 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A20Q9NP91 592 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CITO14578 2027 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM12O43184 909 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CRYZL1O95825 349 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RAB31Q13636 194 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 COMTD1Q86VU5 262 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 IL17RDQ8NFM7 739 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ16Q9NPI9 418 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF4Q9P032 175 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RCE1Q9Y256 329 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 HBMQ6B0K9 141 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF585AQ6P3V2 769 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GLB1L2Q8IW92 636 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR1S1Q8NH92 325 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA17P01571 189 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF4P43489 277 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SRYQ05066 204 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NRARPQ7Z6K4 114 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL3Q9HB03 270 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 A6NIN4 97 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MT-CO2P00403 227 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CX3CR1P49238 355 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB3Q13509 450 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 STEAP2Q8NFT2 490 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SORCS2Q96PQ0 1159 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SYT5O00445 386 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB103AP81534 67 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF17Q02223 184 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SULF2Q8IWU5 870 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GLTPQ9NZD2 209 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MEIS3P1A6NDR6 274 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 FZD7O75084 574 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL6BO94805 426 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PKLRP30613 574 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC15Q96J42 360 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 BIN3Q9NQY0 253 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NCDNQ9UBB6 729 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MOKQ9UQ07 419 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms