RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abca1P41233 2261 aa16.89■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pramef6A2A8M8 474 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp993A2A8V4 313 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klhl15A2AAX3 604 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 A630010A05RikA9C473 232 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp992B1ASD8 573 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm15155B1B034 138 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 P01808 119 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 P03976 113 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Muc13P19467 573 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxd1Q01822 328 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 CbfbQ08024 187 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rabl6Q5U3K5 725 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnh1Q60603 989 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ripk1Q60855 656 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dlx3Q64205 287 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trim46Q7TNM2 759 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1087Q7TR63 313 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 ClmQ7TSN2 230 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp991Q8R1N3 573 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr827Q8VEV5 322 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Defb6Q91VD6 63 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifrd2Q9D8U0 441 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cryba2Q9JJV1 197 aa16.88■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 A26c2A0A140LHE4 291 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Exoc3l2D3YUP5 789 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Izumo4D3Z690 227 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Samd15F6XZJ7 620 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 RrhO35214 337 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Elovl3O35949 271 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fv4P11370 679 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 RxrbP28704 520 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5800Q497L3 186 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc6a3Q61327 619 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zrsr1Q64707 428 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 BC080695Q66JY9 481 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sort1Q6PHU5 825 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mief1Q8BGV8 463 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp763Q8BIC7 588 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc44a2Q8BY89 706 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpat4Q8K2C8 456 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr170Q8VGL6 313 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tpra1Q99MU1 369 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem269Q9D4Y8 254 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Echdc3Q9D7J9 300 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ldb3Q9JKS4 723 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Crybb1Q9WVJ5 250 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 CubnQ9JLB4 3623 aa16.87■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stab1Q8R4Y4 2571 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifit3bE9PV48 403 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm45837F7D3W5 961 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20696H3BJN7 74 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mcpt9O35164 246 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdh12O55134 1180 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 P04946 108 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nkx2-2P42586 273 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr1bP70700 1135 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rslcan18Q7M6X5 460 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Enoph1Q8BGB7 257 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Yod1Q8CB27 343 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wipi1Q8R3E3 446 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ogfrl1Q8VE52 464 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smc6Q924W5 1097 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scamp2Q9ERN0 329 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nf1Q04690 2841 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa16.86■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10376D3YXI8 184 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm3676D3Z236 184 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20518E9Q548 580 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10375L7N286 184 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm3573L7N292 184 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r60L7N2A1 853 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atn1O35126 1175 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 TfamP40630 243 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Impdh1P50096 514 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tas2r7P59530 312 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 RptnP97347 1118 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 JPT1P97825 154 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp39Q02525 718 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr18Q0VAX9 331 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 4930480E11RikQ0VG34 394 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700066B19RikQ3TS39 127 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem151aQ6GQT5 468 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fndc11Q80WB0 326 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tspan9Q8BJU2 239 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 MaelQ8BVN9 434 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 LaynQ8C351 381 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr693Q8VF89 316 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrg1Q91XL1 342 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnps1Q99M28 305 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 GsdmcQ99NB5 468 aa16.85■□□□□ 0.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.4 ms