Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LHE4

A26c2, ANKRD26-like family C, member 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A26c2A0A140LHE4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
A26c2A0A140LHE4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
A26c2A0A140LHE4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
A26c2A0A140LHE4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
A26c2A0A140LHE4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
A26c2A0A140LHE4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
A26c2A0A140LHE4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
A26c2A0A140LHE4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
A26c2A0A140LHE4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29■■■□□ 2.23
A26c2A0A140LHE4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A26c2A0A140LHE4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A26c2A0A140LHE4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A26c2A0A140LHE4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A26c2A0A140LHE4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
A26c2A0A140LHE4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
A26c2A0A140LHE4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
A26c2A0A140LHE4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A26c2A0A140LHE4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A26c2A0A140LHE4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A26c2A0A140LHE4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A26c2A0A140LHE4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A26c2A0A140LHE4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A26c2A0A140LHE4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A26c2A0A140LHE4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A26c2A0A140LHE4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A26c2A0A140LHE4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A26c2A0A140LHE4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A26c2A0A140LHE4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A26c2A0A140LHE4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A26c2A0A140LHE4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A26c2A0A140LHE4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A26c2A0A140LHE4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
A26c2A0A140LHE4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A26c2A0A140LHE4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A26c2A0A140LHE4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A26c2A0A140LHE4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A26c2A0A140LHE4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A26c2A0A140LHE4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A26c2A0A140LHE4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A26c2A0A140LHE4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A26c2A0A140LHE4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A26c2A0A140LHE4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A26c2A0A140LHE4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A26c2A0A140LHE4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A26c2A0A140LHE4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A26c2A0A140LHE4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A26c2A0A140LHE4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A26c2A0A140LHE4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A26c2A0A140LHE4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A26c2A0A140LHE4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A26c2A0A140LHE4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A26c2A0A140LHE4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A26c2A0A140LHE4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A26c2A0A140LHE4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A26c2A0A140LHE4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
A26c2A0A140LHE4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A26c2A0A140LHE4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A26c2A0A140LHE4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A26c2A0A140LHE4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A26c2A0A140LHE4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A26c2A0A140LHE4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A26c2A0A140LHE4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A26c2A0A140LHE4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A26c2A0A140LHE4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A26c2A0A140LHE4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A26c2A0A140LHE4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A26c2A0A140LHE4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A26c2A0A140LHE4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A26c2A0A140LHE4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A26c2A0A140LHE4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A26c2A0A140LHE4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A26c2A0A140LHE4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
A26c2A0A140LHE4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A26c2A0A140LHE4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A26c2A0A140LHE4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A26c2A0A140LHE4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A26c2A0A140LHE4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A26c2A0A140LHE4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A26c2A0A140LHE4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A26c2A0A140LHE4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A26c2A0A140LHE4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A26c2A0A140LHE4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
A26c2A0A140LHE4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A26c2A0A140LHE4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A26c2A0A140LHE4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A26c2A0A140LHE4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A26c2A0A140LHE4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A26c2A0A140LHE4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A26c2A0A140LHE4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A26c2A0A140LHE4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A26c2A0A140LHE4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A26c2A0A140LHE4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A26c2A0A140LHE4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A26c2A0A140LHE4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A26c2A0A140LHE4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A26c2A0A140LHE4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A26c2A0A140LHE4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A26c2A0A140LHE4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A26c2A0A140LHE4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A26c2A0A140LHE4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms