RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597400.5

ZNF548-207, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ZNF548, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-207ENST00000597400 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NOTCH1P46531 2555 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 FAM187AA6NFU0 413 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 PDPK1O15530 556 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 STAMBPO95630 424 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 BMP4P12644 408 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 GIFP27352 417 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 GPC1P35052 558 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 QPRTQ15274 297 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 KLHL26Q53HC5 615 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 PRR31Q5SQ13 230 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CDS1Q92903 461 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 APH1AQ96BI3 265 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 FKRPQ9H9S5 495 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 HHATLQ9HCP6 504 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 ASB6Q9NWX5 421 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 METRNQ9UJH8 293 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NFU1Q9UMS0 254 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SERTM1A2A2V5 107 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 FAM157AC9JC47 383 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LCN1P31025 176 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 DEFA6Q01524 100 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LGALS3BPQ08380 585 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 C2orf54Q08AI8 447 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CCNIQ14094 377 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 ADIPOQQ15848 244 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 DEF8Q6ZN54 512 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 JADE3Q92613 823 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 BTBD2Q9BX70 525 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 A0A0A6YYJ9 748 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TMPRSS2O15393 492 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 ALOX5P09917 674 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LYNX1P0DP58 116 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 PGCP20142 388 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SERPINB4P48594 390 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CCR4P51679 360 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CHN2P52757 468 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LCP2Q13094 533 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 KIAA0040Q15053 153 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 PDK3Q15120 406 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SYT14P1Q58G82 188 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TEX35Q5T0J7 233 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CDC73Q6P1J9 531 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CCDC103Q8IW40 242 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 ARL5BQ96KC2 179 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 PAFAH2Q99487 392 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-207ENST00000597400 CA10Q9NS85 328 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms