RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 HTR1AP08908 422 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC159P0C7I6 412 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ARL9Q6T311 187 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NSMAFQ92636 917 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MED11Q9P086 117 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 A8MVM7 634 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C21orf140B9A014 251 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PDCD5O14737 125 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PHYHO14832 338 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA10O75578 1167 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CYB5AP00167 134 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 F10P00742 488 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF20P17024 532 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MTNR1AP48039 350 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MC2RQ01718 297 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PROX2Q3B8N5 592 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LNP1A1A4G5 178 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 XPNPEP2O43895 674 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NKX2-2O95096 273 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DPB1P04440 258 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CD36P16671 472 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K8P41279 467 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35A1P78382 337 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PTOV1Q86YD1 416 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LAT2Q9GZY6 243 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ARL6IP5O75915 188 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 APOC1P02654 83 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NAGAP17050 411 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MYF6P23409 242 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MMP11P24347 488 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ELK4P28324 431 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EVI2BP34910 448 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CDH15P55291 814 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT8Q9NY28 637 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LRP3O75074 770 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 H2BFMP0C1H6 154 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ABOP16442 354 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC1A3P43003 542 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ACTA2P62736 377 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ACTG2P63267 376 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC80Q76M96 950 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MCFD2Q8NI22 146 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRQ8 180 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GGT2P36268 569 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GIPRP48546 466 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SPATC1Q76KD6 591 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC15A4Q8N697 577 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 WDR54Q9H977 334 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms