RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP6P35125 1406 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC162PA2VCL2 907 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 HELTA6NFD8 242 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEACAM18A8MTB9 384 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf98E9PRG8 122 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 UPK2O00526 184 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGRMC2O15173 223 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0513O60268 411 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBX10O75333 385 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCRG1O75711 98 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALCAP01258 141 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-DQB1P01920 261 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGK2P07205 417 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAGP10523 405 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMB5P28074 263 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGM1P36871 562 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAMPTP43490 491 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLR1P78380 273 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPAL4Q0D2K0 466 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRM3Q14832 879 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC10Q5BKY1 277 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMCO4Q5TGY1 634 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM46CQ5VWP2 391 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSDL2Q6YN16 418 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZTI0 123 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX20Q7Z614 316 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 POMGNT2Q8NAT1 580 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR9A4Q8NGU2 314 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTRT1Q8TDG2 376 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5P3Q8WZ94 311 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOB3AQ96BX8 217 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR137Q96N19 417 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2V2Q96R30 315 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2A14Q96R47 310 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH3GL3Q99963 347 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 REEP2Q9BRK0 252 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR174Q9BXC1 333 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHIAQ9BZP6 476 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH20Q9HBT6 801 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED9Q9NWA0 146 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 EHFQ9NZC4 300 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 BSNQ9UPA5 3926 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV6A0A075B6T7 132 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PPQ1 181 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PEX7O00628 323 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSPAN4O14817 238 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASGRF2O14827 1237 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN2BO60939 215 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANXA9O76027 345 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE5AO76074 875 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFN2O95140 757 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFB10O96000 172 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD55P08174 381 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB40ALP0C0E4 278 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALPPL2P10696 532 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDC1P18827 310 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACKR3P25106 362 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL4P36578 427 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 GYG1P46976 350 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFX3P48380 749 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1CBP62140 327 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL1RL1Q01638 556 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM14Q14142 442 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF699Q32M78 642 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUT11Q495W5 492 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMUG1Q53HV7 270 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL35Q6PF15 583 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARCQ7LC44 396 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCF23Q7RTU1 214 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUBCNQ92622 972 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYCR2Q96C36 320 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 BPIFA2Q96DR5 249 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBXN10Q96LJ8 280 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC114Q96M63 670 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFP3Q96NJ6 502 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEPHS2Q99611 448 aa-1.78□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms