RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409403.6

CLK1-202, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CLK1, Length 1,664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-202ENST00000409403 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 MCIDASD6RGH6 385 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 WWP2O00308 870 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 PHYHO14832 338 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 SPRY2O43597 315 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 SDC3O75056 442 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 NMBP08949 121 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 CD79BP40259 229 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 SERPINA11Q86U17 422 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 ISCA2Q86U28 154 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 ASB13Q8WXK3 278 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 CHFRQ96EP1 664 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 AP4M1O00189 453 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 CD1DP15813 335 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLK1-202ENST00000409403 CD53P19397 219 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 HIST1H2ADP20671 130 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 MAKP20794 623 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 EVX1P49640 407 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 SUOXP51687 545 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 DEFA5Q01523 94 aa5.05□□□□□ -1.6
CLK1-202ENST00000409403 DEFA6Q01524 100 aa5.05□□□□□ -1.6
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