RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SFXN5Q8TD22 340 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DCUN1D4Q92564 292 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NT5DC2Q9H857 520 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NTN4Q9HB63 628 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 IL26Q9NPH9 171 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0355O15063 1070 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FABP7O15540 132 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NCR1O76036 304 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R3DO95685 299 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CHATP28329 748 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TAP2Q03519 686 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TEAD2Q15562 447 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HACD4Q5VWC8 232 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 AWAT2Q6E213 333 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF583Q96ND8 569 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SMLR1H3BR10 107 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SYT7O43581 403 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C6P13671 934 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRPH2P23942 346 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DLX5P56178 289 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF92Q03936 586 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RUNX2Q13950 521 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC14A2Q15849 920 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CCNJQ5T5M9 372 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CBLL1Q75N03 491 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PDZD3Q86UT5 571 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RNF175Q8N4F7 328 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ISL2Q96A47 359 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC39A13Q96H72 371 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRRT1Q99946 306 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HMX2A2RU54 273 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 IL1AP01583 271 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINA5P05154 406 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UBL4AP11441 157 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KITLGP21583 273 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB10P40306 273 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DAPP51397 102 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 FOXJ1Q92949 421 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SGCZQ96LD1 299 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ARID1AO14497 2285 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 J3KTA2 159 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 AP1G1O43747 822 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KNG1P01042 644 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PNMTP11086 282 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UGT2B7P16662 529 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TGM4P49221 684 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 LCN10Q6JVE6 187 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LEG1Q6P5S2 330 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 NOX3Q9HBY0 568 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-202ENST00000400053 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RNF212BA8MTL3 300 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CACNG3O60359 315 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFB2O95178 105 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PDGFAP04085 211 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GYPBP06028 91 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 AHRP35869 848 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PIGAP37287 484 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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