RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T4Q8NH00 348 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NT5CQ8TCD5 201 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 HERVK_113Q902F9 699 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EDAQ92838 391 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GIMAP5Q96F15 307 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TEAD3Q99594 435 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GPA33Q99795 319 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.18□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MTG2Q9H4K7 406 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RERGLQ9H628 205 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR26Q9H7D7 661 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CNIH4Q9P003 139 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 UPB1Q9UBR1 384 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MALT1Q9UDY8 824 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NINQ8N4C6 2090 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPV9 198 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BLACEA4D250 179 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLON5A6NGN9 336 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TTLL8A6PVC2 850 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 H7BY64 318 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 L7N2F9 121 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PHYHO14832 338 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TSC22D2O75157 780 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RP2O75695 350 aa7.17□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 CSF1P09603 554 aa7.17□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 PPP3CBP16298 524 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EPCAMP16422 314 aa7.17□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKAG1P54619 331 aa7.17□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF17Q02223 184 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 STX4Q12846 297 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FGFBP1Q14512 234 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIN2CQ14957 1233 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CDK5R1Q15078 307 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 USP53Q70EK8 1073 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF550Q7Z398 422 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CDH26Q8IXH8 852 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.17□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC107Q8WV48 283 aa7.17□□□□□ -1.26
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