RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517251.1

SCARNA20.6-201, small Cajal body-specific RNA 20, humanhuman

BASIC

Gene SCARNA20, Length 106 nt, Biotype scaRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LANCL1O43813 399 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SCO2O43819 266 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 B3GALT2O43825 422 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 HCN1O60741 890 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 HPGDSO60760 199 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PTP4A3O75365 173 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 NCR1O76036 304 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 WISP1O95388 367 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PPP1R3DO95685 299 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DLGAP3O95886 979 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 AGR2O95994 175 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 WNT11O96014 354 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 IGF2P01344 180 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 WNT1P04628 370 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DBIP07108 87 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ADRB1P08588 477 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SBK2P0C263 348 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GKN3PP0CG01 181 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CT45A8P0DMV1 189 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CT45A9P0DMV2 189 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CD8BP10966 210 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MYL12AP19105 171 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 HK1P19367 917 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CD53P19397 219 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DRD5P21918 477 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CPN2P22792 545 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CFL1P23528 166 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 APEX1P27695 318 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CFPP27918 469 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 UQCRC1P31930 480 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 S100A5P33763 92 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MPIP34949 423 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 HOXD12P35452 270 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SOX6P35712 828 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RBM34P42696 430 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MAP2K3P46734 347 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CAPZBP47756 277 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FASLGP48023 281 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MTNR1BP49286 362 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FNTBP49356 437 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 EVX1P49640 407 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RORCP51449 518 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CCR5P51681 352 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LBX1P52954 281 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PRKAG1P54619 331 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 COPZ1P61923 177 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 YPEL5P62699 121 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PPP3R1P63098 170 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MXD1Q05195 221 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TGM3Q08188 693 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SKP2Q13309 424 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GALEQ14376 348 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KIR2DS5Q14953 304 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CDK5R1Q15078 307 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 OR1Q1Q15612 314 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TAB1Q15750 504 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CD226Q15762 336 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SNAPC1Q16533 368 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CARTPTQ16568 116 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 AMZ1Q400G9 498 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GXYLT1Q4G148 440 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CDONQ4KMG0 1287 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KLHL22Q53GT1 634 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PLA1AQ53H76 456 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CT45A2Q5DJT8 189 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CEP78Q5JTW2 689 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PDZK1Q5T2W1 519 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ZNF684Q5T5D7 378 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 STPG1Q5TH74 334 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 HBMQ6B0K9 141 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ASPHD2Q6ICH7 369 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 XKRXQ6PP77 449 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LYPD4Q6UWN0 246 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 IL20RBQ6UXL0 311 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 B3GLCTQ6Y288 498 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MED25Q71SY5 747 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MTSS1LQ765P7 747 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ZNF438Q7Z4V0 828 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 C11orf74Q86VG3 221 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KLBQ86Z14 1044 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LIX1LQ8IVB5 337 aa2.99□□□□□ -1.93
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CPOQ8IVL8 374 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms