RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 IL18BPO95998 194 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 BMP2P12643 396 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 COX6B1P14854 86 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 IGFBP2P18065 325 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 FADDQ13158 208 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 QPRTQ15274 297 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TMEM19Q96HH6 336 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ZFP3Q96NJ6 502 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 HEATR5AQ86XA9 2040 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.83■□□□□ 0.61
ACTB-211ENST00000480301 A0A0J9YW62 118 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ADAMDEC1O15204 470 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 BCHEP06276 602 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ELK4P28324 431 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 OPRM1P35372 400 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 RETREG3Q86VR2 466 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CMIPQ8IY22 773 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 LILRA2Q8N149 483 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 C10orf111Q8N326 155 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 TSPEARQ8WU66 669 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CALML5Q9NZT1 146 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ZNF175Q9Y473 711 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ADAM11O75078 769 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PRF1P14222 555 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 IL7RP16871 459 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PGCP20142 388 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ME2P23368 584 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SHC1P29353 583 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CRISP3P54108 245 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PON3Q15166 354 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 P4HA3Q7Z4N8 544 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 GCNT2Q8N0V5 402 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 DPP10Q8N608 796 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 OR10D3Q8NH80 312 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 FNDC9Q8TBE3 224 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 WDR60Q8WVS4 1066 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ST8SIA1Q92185 356 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 MAL2Q969L2 176 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SFXN3Q9BWM7 321 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 IKZF5Q9H5V7 419 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 A4GALTQ9NPC4 353 aa18.82■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 HCFC1P51610 2035 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1DQ01668 2161 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 MED12LQ86YW9 2145 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JPF8 293 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SYT5O00445 386 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 CXCL13O43927 109 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 DLX5P56178 289 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SESN3P58005 492 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SGCBQ16585 318 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
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ACTB-211ENST00000480301 PEX5LQ8IYB4 626 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 OR52P1PQ8NH57 321 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 KLHL15Q96M94 604 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 BCL2L10Q9HD36 194 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 TMEM247A6NEH6 219 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF11O14788 317 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ANGPT2O15123 496 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF13O75888 250 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 AQP8O94778 261 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 NID1P14543 1247 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 GPX2P18283 190 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 RYKP34925 604 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 SFTPDP35247 375 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 ASCL1P50553 236 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 GNA13Q14344 377 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa18.8■□□□□ 0.6
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