RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 TFAP2AP05549 437 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 REEP5Q00765 189 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 HYAL1Q12794 435 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 LANCL3Q6ZV70 420 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ZNF683Q8IZ20 524 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CCDC32Q9BV29 185 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RBM34P42696 430 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CSNK1A1P48729 337 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 F5P12259 2224 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 MAP2K3P46734 347 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RAB12Q6IQ22 244 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 KMT5CQ86Y97 462 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 NRMQ8IXM6 262 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CHPT1Q8WUD6 406 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 C19orf43Q9BQ61 176 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ASIC5Q9NY37 505 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RNF215Q9Y6U7 377 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PPC4 97 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 K7ESM1 405 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 B4GAT1O43505 415 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ALPLP05186 524 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 NKX3-2P78367 333 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 TMEM31Q5JXX7 168 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 WBP2NLQ6ICG8 309 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 C3orf33Q6P1S2 294 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 OR1J4Q8NGS1 313 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 C1QAP02745 245 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CD3GP09693 182 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ANXA3P12429 323 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 S100A2P29034 98 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PTGER1P34995 402 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 OR1D4P47884 311 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 NCS1P62166 190 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ULK3Q6PHR2 472 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 NOXA1Q86UR1 476 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 FOXQ1Q9C009 403 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PRDM9Q9NQV7 894 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 S100PBPQ96BU1 408 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 QPCTLQ9NXS2 382 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 APOC3P02656 99 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 POU2F2P09086 479 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 FURINP09958 794 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PKLRP30613 574 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 SPRED1Q7Z699 444 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 SLC2A12Q8TD20 617 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 HCAR1Q9BXC0 346 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ALG5Q9Y673 324 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 NUMA1Q14980 2115 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 TRAV6A0A075B6T7 132 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 SNAPC5O75971 98 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 LEG1Q6P5S2 330 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 MMP21Q8N119 569 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 SLC46A1Q96NT5 459 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 BCL7BQ9BQE9 202 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 LDB3O75112 727 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ARAFP10398 606 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 FRKP42685 505 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 LRFN4Q6PJG9 635 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 IL20RBQ6UXL0 311 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PRR22Q8IZ63 422 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ZNF611Q8N823 705 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RAB39BQ96DA2 213 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 CCDC120Q96HB5 630 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 KCMF1Q9P0J7 381 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 VDAC3Q9Y277 283 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 TTC3P53804 2025 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 SMIM30A4D0T7 59 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ACVR1BP36896 505 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 IL10RAQ13651 578 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 RAB11FIP2Q7L804 512 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 FAM109AQ8N4B1 249 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-207ENST00000479054 ZNF615Q8N8J6 731 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms