RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 SEC14L5O43304 696 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAM11O75078 769 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 PRKCAP17252 672 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 IL11P20809 199 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 CLDN20P56880 219 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 BCL2A1Q16548 175 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 METTL25Q8N6Q8 603 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 PIF1Q9H611 641 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa21.52■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 AIM2O14862 343 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJA2O60884 412 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 OPN1LWP04000 364 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 AQP1P29972 269 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF1P41567 113 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SMSP52788 366 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CLDN15P56746 228 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SEM1Q6ZVN7 128 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 RND1Q92730 232 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM185BQ9H7F4 350 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 A1L4Q6 167 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CDHR4A6H8M9 788 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 EPPINO95925 133 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 THBS1P07996 1170 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 PGCP20142 388 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SERPINA11Q86U17 422 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SH3GL1Q99961 368 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 IFT52Q9Y366 437 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 AP3D1O14617 1153 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM107AO95990 144 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ETS2P15036 469 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 GZMMP51124 257 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SESN3P58005 492 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.039e-6■■□□□ 14.4
UBE2E3-202ENST00000410062 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 GGNQ86UU5 652 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 MEIOBQ8N635 442 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 HIPK4Q8NE63 616 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF563Q8TA94 476 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SDCCAG3Q96C92 435 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 MRGPRX4Q96LA9 322 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPN13Q12923 2485 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCA1A8K7I4 914 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 EFNA2O43921 213 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 NTN1O95631 604 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 GKN3PP0CG01 181 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ADH6P28332 368 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 RAC1P63000 192 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CDSNQ15517 529 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC25A53Q5H9E4 307 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF220Q5VTB9 566 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CMTM5Q96DZ9 223 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ECSITQ9BQ95 431 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF6Q9Y252 685 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ICE1Q9Y2F5 2266 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 TOXO94900 526 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A8P48029 635 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 RBBP4Q09028 425 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 XKRXQ6PP77 449 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT73Q86Y46 540 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 LACC1Q8IV20 430 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 LILRA2Q8N149 483 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 TNIP2Q8NFZ5 429 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 ST8SIA1Q92185 356 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 SPATA9Q9BWV2 254 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CALHM2Q9HA72 323 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 COQ3Q9NZJ6 369 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-202ENST00000410062 STOML1Q9UBI4 398 aa21.48■■□□□ 1.03
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