RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366517.5

SMYD3-202, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMYD3, Length 1,372 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-202ENST00000366517 PDYNP01213 254 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 GSTA1P08263 222 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ABHD2P08910 425 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CT45A8P0DMV1 189 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CT45A9P0DMV2 189 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FCGR2AP12318 317 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PEPDP12955 493 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 IL12BP29460 328 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 HSD17B3P37058 310 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CPA2P48052 419 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 LHX2P50458 406 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ARFIP2P53365 341 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ERVFRD-1P60508 538 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 LCP2Q13094 533 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TRADDQ15628 312 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SGO1Q5FBB7 561 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 DCST1Q5T197 706 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 MNS1Q8NEH6 495 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TMBIM1Q969X1 311 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CCDC126Q96EE4 140 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SFXN2Q96NB2 322 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 NODALQ96S42 347 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FMO2Q99518 471 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FOXB1Q99853 325 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FANCFQ9NPI8 374 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 A0A1W2PNV4 684 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SLC22A20A6NK97 555 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 EMC8O43402 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PCDH7O60245 1069 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZIC3O60481 467 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ESRRBO95718 433 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TSPAN15O95858 294 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 MT-ND5P03915 603 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CELA3BP08861 270 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PPP3CBP16298 524 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 DDCP20711 480 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 IMPDH1P20839 514 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 DPP4P27487 766 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 LCN1P31025 176 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CD79BP40259 229 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 MC3RP41968 323 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PRKAA2P54646 552 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CLDN18P56856 261 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CORO7P57737 925 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ROM1Q03395 351 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 MVKQ03426 396 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SCARB2Q14108 478 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 PRR22Q8IZ63 422 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 FADS6Q8N9I5 356 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 DOK4Q8TEW6 326 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.69□□□□□ -1.34
SMYD3-202ENST00000366517 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms