RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 BMP2P12643 396 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 IGFBP2P18065 325 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CTSSP25774 331 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SFTPDP35247 375 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SLC6A8P48029 635 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 PON3Q15166 354 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP1BQ7LBR1 199 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 VRK2Q86Y07 508 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 OR10D3Q8NH80 312 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 TM9SF2Q99805 663 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 AP3D1O14617 1153 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DVL2O14641 736 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 TNFSF11O14788 317 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 AQP8O94778 261 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 COX6B1P14854 86 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RYKP34925 604 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 EIF1P41567 113 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DLX5P56178 289 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A53Q5H9E4 307 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 LILRA2Q8N149 483 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 WDR60Q8WVS4 1066 aa24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CXCL13O43927 109 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ELK4P28324 431 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CRISP3P54108 245 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SESN3P58005 492 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF836Q6ZNA1 936 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 P4HA3Q7Z4N8 544 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 OR2V1Q8NHB1 315 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 C10orf82Q8WW14 230 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 MRGPRX4Q96LA9 322 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL15Q96M94 604 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 A4GALTQ9NPC4 353 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SAR1AQ9NR31 198 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RLIMQ9NVW2 624 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFAF1Q9Y375 327 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 GMEB1Q9Y692 573 aa24.23■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CACNA1CQ13936 2221 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 FBP2O00757 339 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMDEC1O15204 470 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 TNFSF13O75888 250 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 NID1P14543 1247 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ADH6P28332 368 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 FADDQ13158 208 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SELPLGQ14242 412 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SGCBQ16585 318 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 OR52P1PQ8NH57 321 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF175Q9Y473 711 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CHST2Q9Y4C5 530 aa24.22■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PNV4 684 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ANGPT2O15123 496 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DBIP07108 87 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 PGCP20142 388 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ME2P23368 584 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 GCNT6Q5T4J0 391 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 PPP4R4Q6NUP7 873 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 PEX5LQ8IYB4 626 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DPP10Q8N608 796 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SPOCK3Q9BQ16 436 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SRXN1Q9BYN0 137 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RAD21L1Q9H4I0 556 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RNF122Q9H9V4 155 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CALML5Q9NZT1 146 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 UNC79Q9P2D8 2635 aa24.21■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 IL18BPO95998 194 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ARAFP10398 606 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 IL7RP16871 459 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 OPRM1P35372 400 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ASCL1P50553 236 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 KLF10Q13118 480 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 RUNDC3AQ59EK9 446 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 HBMQ6B0K9 141 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 VWA1Q6PCB0 445 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms