RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC16A	O15027	2179 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF4	O43474	513 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	OIP5	O43482	229 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	MPZL2	O60487	215 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LRP3	O75074	770 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6B1	O95007	311 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	MT-CO3	P00414	261 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	UMOD	P07911	640 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NGFR	P08138	427 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	GABRB1	P18505	474 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CCR4	P51679	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SKP2	Q13309	424 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SGCD	Q92629	289 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PQD3	144 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF264	O43296	627 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PPM1B	O75688	479 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	DLGAP3	O95886	979 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	HTR1A	P08908	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	IFI30	P13284	250 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	EVI2B	P34910	448 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FOLR3	P41439	243 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	STAT5A	P42229	794 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	COPZ1	P61923	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKCD	Q05655	676 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	GINS1	Q14691	196 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NEDD8	Q15843	81 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.27	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	UNC119B	A6NIH7	251 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	WWP2	O00308	870 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	PLD2	O14939	933 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	SCO2	O43819	266 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFAND5	O76080	213 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	COX6A1	P12074	109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	SMS	P52788	366 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	CTBP2	P56545	445 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	CSNK2B	P67870	215 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35A2	P78381	396 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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