RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 INSRP06213 1382 aa4.01□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 A2MP01023 1474 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NCOA2Q15596 1464 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MSGN1A6NI15 193 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRR3A8MPY1 467 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 G3V4G9 280 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ERI5 159 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFSF12O43508 249 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAB2O43741 272 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE5AO76074 875 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 STAMBPO95630 424 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TPM3P06753 285 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SP1P08047 785 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNB1P14635 433 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SRMP19623 302 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 EDNRAP25101 427 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RDXP35241 583 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD17B2P37059 387 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DCTP40126 519 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 STARP49675 285 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 EMC2Q15006 297 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB35Q15286 201 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SYCP1Q15431 976 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TP53I3Q53FA7 332 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC50Q53HI1 259 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR38Q5JTN6 314 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LIN9Q5TKA1 542 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR5LQ6MZQ0 368 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MOB2Q70IA6 237 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNMB4Q86W47 210 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 FGFRL1Q8N441 504 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRSXQ8N5I4 330 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2T11Q8NH01 316 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SCARB1Q8WTV0 552 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MITD1Q8WV92 249 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM218AQ96MZ4 157 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 IL17FQ96PD4 163 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 IL4I1Q96RQ9 567 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OVOL2Q9BRP0 275 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 AZI2Q9H6S1 392 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5MQ9NPB1 228 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MIA2Q96PC5 1412 aa4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PREX2Q70Z35 1606 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP1Q9C000 1473 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0J9YYE9 177 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF724A8MTY0 619 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 F5H6K3 240 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 YKT6O15498 198 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2F2O95006 317 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DIRAS1O95057 198 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBC1P01850 177 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHG3P01860 377 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXB7P09629 217 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKACBP22694 351 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBG1P23258 451 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CD1CP29017 333 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R1BP30154 601 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 BCAP31P51572 246 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NDST2P52849 883 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DAOAP59103 153 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB11AP62491 216 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCY2DQ02846 1103 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KLRC3Q07444 240 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ASPHQ12797 758 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KLRB1Q12918 225 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CD226Q15762 336 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB11BQ15907 218 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC15A2Q16348 729 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL38Q2WGJ6 581 aa3.99□□□□□ -1.77
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