RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il23aQ9EQ14 196 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hipk3Q9ERH7 1192 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdzk1Q9JIL4 519 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1306A2BFL7 312 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Osbpl8B9EJ86 889 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam53aE9PV82 402 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdhr4H3BJZ2 783 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6351K9J7D1 481 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F10O88947 481 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcd4O89016 606 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstm3P19639 218 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfsf4P43488 198 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PkibQ04758 92 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map3k8Q07174 467 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cass4Q08EC4 804 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Micall2Q3TN34 1009 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxpe2Q3U095 558 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm44Q3V089 1013 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hephl1Q3V1H3 1159 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RgmaQ6PCX7 454 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1hQ8BVE3 483 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Catsper4Q8BVN3 442 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps6ka5Q8C050 863 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb8bQ8CII0 484 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pom121Q8K3Z9 1200 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc38a4Q8R1S9 547 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znhit1Q8R331 154 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc9a8Q8R4D1 576 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1459Q8VFV9 307 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erlin1Q91X78 346 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aipl1Q924K1 328 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr146Q99LE2 333 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl24Q9CQ06 216 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem43Q9DBS1 400 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnft1Q9DCN7 395 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2rx4Q9JJX6 388 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14401A2ARV7 303 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlgap4B1AZP2 992 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam71dD3YV92 440 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3233E9Q2H5 230 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Raph1F2Z3U3 1266 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1331K7N684 317 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf143O70230 638 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01852 173 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkx2-2P42586 273 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nr5a2P45448 560 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfap2P55002 183 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nanos2P60322 136 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abce1P61222 599 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr681Q3SXH8 315 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ipcef1Q5DU31 406 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bhlha9Q5RJB0 231 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krtcap2Q5RL79 136 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adora2bQ60614 332 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Runx1t1Q61909 577 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgoln1Q62313 353 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btn1a1Q62556 524 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pou4f3Q63955 338 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glt8d2Q640P4 349 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem158Q6F5E0 286 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Szrd1Q6NXN1 152 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1333Q7TQV7 317 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC049730Q810N3 246 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clrn3Q8BHH8 226 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekhm3Q8BM47 761 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rap2cQ8BU31 183 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrfn5Q8BXA0 719 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8CIL4 281 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf11Q8K1S5 502 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sirt4Q8R216 333 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr679Q8VGV0 315 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cts7Q91ZF2 331 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim7Q923T7 510 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prps2Q9CS42 318 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armc10Q9D0L7 306 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spns3Q9D232 514 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933421I07RikQ9D420 214 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn8Q9Z260 225 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dennd4cA6H8H2 1906 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DscamQ9ERC8 2013 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2610044O15Rik8A0A087WRJ1 410 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc9a6A1L3P4 702 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd300ld2A2A7W0 305 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtprhE9Q0N2 971 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3250E9Q1M3 230 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc21E9Q8D0 531 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20696H3BJN7 74 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FaimlJ3QPY3 178 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.4 ms