RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 CDHR4A6H8M9 788 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 MKRN2OSH3BPM6 223 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FCMRO60667 390 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FMO6PO60774 539 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ICOSLGO75144 302 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 UGT2B11O75310 529 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 UGT2B17O75795 530 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 OR6B1O95007 311 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SNX4O95219 450 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 LGI1O95970 557 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 CSTAP01040 98 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 IGKV1D-16P01601 117 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 C1QCP02747 245 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 OPN1SWP03999 348 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 P04436 131 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 CAPNS1P04632 268 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 IFNW1P05000 195 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 CELA2AP08217 269 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 RAP2AP10114 183 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 UBL4AP11441 157 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC7A1P30825 629 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC6A8P48029 635 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FBXW4P57775 412 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SMIM11AP58511 58 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNJ10P78508 379 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 C17orf67Q0P5P2 114 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FGFBP1Q14512 234 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 MAPK11Q15759 364 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 NRF1Q16656 503 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 KLHL26Q53HC5 615 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 PDZK1Q5T2W1 519 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FCRLBQ6BAA4 426 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 BORAQ6PGQ7 559 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 IL20RBQ6UXL0 311 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 BEST3Q8N1M1 668 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 RNF138Q8WVD3 245 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 PSMF1Q92530 271 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 HAS2Q92819 552 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 HGDQ93099 445 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 TPD52L3Q96J77 140 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 C5orf34Q96MH7 638 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF347Q96SE7 839 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 CPNE5Q9HCH3 593 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ARMC1Q9NVT9 282 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 STMN3Q9NZ72 180 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 KLRF1Q9NZS2 232 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 LRFN1Q9P244 771 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 AURKCQ9UQB9 309 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 RAXQ9Y2V3 346 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 WIF1Q9Y5W5 379 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 OR5H15A6NDH6 313 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FAAHO00519 579 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 AP3D1O14617 1153 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAMDEC1O15204 470 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF264O43296 627 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SCO2O43819 266 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 FADS1O60427 444 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC25A12O75746 678 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAJB5O75953 348 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 PRKD3O94806 890 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-213ENST00000589475 ANGPTL1O95841 491 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms