RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NDST2	P52849	883 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH17	Q12864	832 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RIG	Q13278	110 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ITIH4	Q14624	930 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGPT1	Q15389	498 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	EXT1	Q16394	746 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PSG3	Q16557	428 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	XKR6	Q5GH73	641 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	XKR4	Q5GH76	650 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	STUM	Q69YW2	141 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC23L	Q6PF05	361 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957		Q7L0L9	218 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT1	Q86TX2	421 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM17	Q86X19	198 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL16	Q8N461	479 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF14	Q92956	283 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NXPE2	Q96DL1	559 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NUS1	Q96E22	293 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OPALIN	Q96PE5	141 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TECTB	Q96PL2	329 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CPXM1	Q96SM3	734 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DPH7	Q9BTV6	452 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	UCK1	Q9HA47	277 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF302	Q9NR11	478 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	AHSP	Q9NZD4	102 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CLN8	Q9UBY8	286 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	STARD10	Q9Y365	291 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DHRS7	Q9Y394	339 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP7	Q9Y680	259 aa		2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	AFF2	P51816	1311 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957		F5H6K3	240 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957		F8VZ95	297 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	BCKDK	O14874	412 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TM9SF1	O15321	606 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MSH4	O15457	936 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	XPNPEP2	O43895	674 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0513	O60268	411 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN2B	O60939	215 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK2AP2	O75956	126 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL2	O95198	593 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2P2	O95744	297 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CLPTM1	O96005	669 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP1B1	P05026	303 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	BCKDHA	P12694	445 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOD1	P15172	320 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NCK1	P16333	377 aa		2.42	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF43	P17038	809 aa		2.42	□□□□□ -2.02

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