RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 NELL2Q99435 816 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CBLCQ9ULV8 474 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 RCBTB2O95199 551 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 IGKV1D-16P01601 117 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 LIMS3P0CW19 117 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 LIMS4P0CW20 117 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 RPS19P39019 145 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FOXQ1Q9C009 403 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 Q9N2J8 555 aa20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 A0A0B4J2E0 115 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1B0GX12 115 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 LMO7DNF2Z398 122 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF749O43361 778 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CHP2O43745 196 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 BCAP31P51572 246 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FXYD6P3P58550 94 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 DSG2Q14126 1118 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CPOQ8IVL8 374 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 GRHL3Q8TE85 626 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TM9SF4Q92544 642 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 DTX4Q9Y2E6 619 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.1■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FUT1P19526 365 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TGM1P22735 817 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 SLC1A3P43003 542 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FNTBP49356 437 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 RORCP51449 518 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 HSD17B7P56937 341 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TPBGQ13641 420 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 GID4Q8IVV7 300 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 UFD1Q92890 307 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM2Q9C040 744 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ISPDA4D126 451 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 BHLHE40O14503 412 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 MAOAP21397 527 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TBXA2RP21731 343 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ETV6P41212 452 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 GPR3P46089 330 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CTBP2P56545 445 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 NXPH1P58417 271 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 SPACA7Q96KW9 195 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FN3KQ9H479 309 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.09■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1B0GWA3 101 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 OR2W5A6NFC9 320 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ATP6V1E1P36543 226 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 PGDP52209 483 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF141Q15928 474 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 PLK5Q496M5 336 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 LNX2Q8N448 690 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 OTULINQ96BN8 352 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ARSGQ96EG1 525 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 RAB33BQ9H082 229 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.08■□□□□ 0.81
SPHK1-201ENST00000323374 FITM1A5D6W6 292 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms