RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262305.8

RAB11FIP3-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP3, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CACNG6Q9BXT2 260 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMEM165Q9HC07 324 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 H3BML4 177 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PKLRP30613 574 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF91Q05481 1191 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RAB11BQ15907 218 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GGHQ92820 318 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HLA-CQ95604 372 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CA5AP35218 305 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C18orf63Q68DL7 685 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VDAC3Q9Y277 283 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ACPPP15309 386 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DAPP51397 102 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MNTQ99583 582 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MYO10Q9HD67 2058 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 I6L893 689 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 K7ESM1 405 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TNFRSF10CO14798 259 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ERVK-25P63136 954 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ERV3-1Q14264 604 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SHHQ15465 462 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PKMYT1Q99640 499 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ANXA3P12429 323 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FOLR3P41439 243 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CTBP2P56545 445 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CDKN3Q16667 212 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NT5DC2Q9H857 520 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FZD6O60353 706 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 OR1D4P47884 311 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LPAL2Q16609 132 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM46BQ96A09 425 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FGF22Q9HCT0 170 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ABCA3Q99758 1704 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC6A12P48065 614 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KIAA1024LP59773 190 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GLO1Q04760 184 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PDE7AQ13946 482 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KLK8O60259 260 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRKXP51817 358 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 S100A10P60903 97 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RAD51DO75771 328 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EGFP01133 1207 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SFTPDP35247 375 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FTMTQ8N4E7 242 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CIB4A0PJX0 185 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GASTP01350 101 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HTR3AP46098 478 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GXYLT1Q4G148 440 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms