RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem17Q8K0U3 198 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Syt17Q920M7 470 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iglon5Q8HW98 336 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1351Q8VGU6 319 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pex16Q91XC9 336 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp995E9Q6M3 437 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm5916G5E8W5 102 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsd3b6O35469 373 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 StomP54116 284 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnajc24Q91ZF0 196 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tktl1Q99MX0 595 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r103E9PWW0 856 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hoxc5P32043 222 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ptger4P32240 513 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pgap1Q3UUQ7 922 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Shisa7Q8C3Q5 558 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1093Q8VF14 322 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9DAE7 121 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 A0A1W2P799 418 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pramef17A2ASJ1 475 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr417F8VQB1 309 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hes1P35428 282 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PepdQ11136 493 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clec4b1Q7TS58 209 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dppa4Q8CCG4 296 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr74Q8VCG3 384 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acsm1Q91VA0 573 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cldn22Q9D7U6 220 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mon2Q80TL7 1715 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cped1B2RX70 1026 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnab1P63143 401 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Commd3Q63829 195 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kctd7Q8BJK1 289 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Steap4Q923B6 470 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zc3h8Q9JJ48 305 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sema6cQ9WTM3 931 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mc3rP33033 323 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mmp12P34960 473 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf222Q8CEF8 211 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ctxn1Q8K129 82 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Snapc5Q8R2K7 98 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Polr2hQ923G2 150 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4933407L21RikQ9D476 131 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp534A2A7A1 661 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nthl1O35980 300 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lgals3bpQ07797 577 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 C5ar2Q8BW93 344 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pla2g15Q8VEB4 412 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep41Q99NF3 373 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Il21Q9ES17 146 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm29797A0A140LIA7 188 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hes5P70120 167 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm773Q3TML4 206 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DrgxQ8BYH0 263 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr18Q8K1Z6 331 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1121L7MTT1 314 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fut7Q11131 389 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bhlhe23Q8BGW3 223 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pamr1Q8BU25 720 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Unc50Q9CQ61 259 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Duox1A2AQ92 1551 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1084A0A1L1STZ9 313 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1082A0A1L1SUC9 313 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pgm2A2CEK3 580 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ceacam3E9Q6J4 706 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bcl6P41183 707 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hs6st2Q80UW0 612 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp874aQ8BX23 447 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbxl20Q9CZV8 436 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Padi1Q9Z185 662 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr85P60894 370 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arntl2Q2VPD4 579 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Klhl9Q6ZPT1 617 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dlgap5Q8K4R9 808 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cwh43Q91YL7 699 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddah2Q99LD8 285 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc18Q9CQ07 262 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DhdhQ9DBB8 333 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp989H3BLB0 661 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fmo9Q8C116 539 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr729Q8VET4 323 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr164Q8VF87 315 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mpzl2O70255 215 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gnb2P62880 340 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam71f1Q3UZD7 341 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8K039 155 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr569Q8VGZ2 314 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Oosp1Q925U0 202 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rexo2Q9D8S4 237 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Insm2Q9JMC2 493 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhcr7O88455 471 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arl6O88848 186 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.9 ms