Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,31■■■□□ 2,92
Ctxn1Q8K129 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Ctxn1Q8K129 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ctxn1Q8K129 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ctxn1Q8K129 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ctxn1Q8K129 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ctxn1Q8K129 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Ctxn1Q8K129 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Ctxn1Q8K129 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Ctxn1Q8K129 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Ctxn1Q8K129 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ctxn1Q8K129 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Ctxn1Q8K129 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Ctxn1Q8K129 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ctxn1Q8K129 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ctxn1Q8K129 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ctxn1Q8K129 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ctxn1Q8K129 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ctxn1Q8K129 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ctxn1Q8K129 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ctxn1Q8K129 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ctxn1Q8K129 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ctxn1Q8K129 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ctxn1Q8K129 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ctxn1Q8K129 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Ctxn1Q8K129 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ctxn1Q8K129 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Ctxn1Q8K129 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ctxn1Q8K129 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ctxn1Q8K129 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ctxn1Q8K129 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ctxn1Q8K129 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ctxn1Q8K129 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ctxn1Q8K129 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
Ctxn1Q8K129 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ctxn1Q8K129 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ctxn1Q8K129 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ctxn1Q8K129 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Ctxn1Q8K129 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ctxn1Q8K129 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ctxn1Q8K129 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ctxn1Q8K129 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctxn1Q8K129 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ctxn1Q8K129 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ctxn1Q8K129 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,83■■□□□ 1,88
Ctxn1Q8K129 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctxn1Q8K129 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ctxn1Q8K129 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ctxn1Q8K129 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ctxn1Q8K129 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ctxn1Q8K129 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ctxn1Q8K129 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ctxn1Q8K129 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ctxn1Q8K129 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ctxn1Q8K129 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ctxn1Q8K129 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctxn1Q8K129 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ctxn1Q8K129 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Ctxn1Q8K129 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ctxn1Q8K129 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ctxn1Q8K129 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ctxn1Q8K129 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ctxn1Q8K129 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ctxn1Q8K129 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ctxn1Q8K129 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Ctxn1Q8K129 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ctxn1Q8K129 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Ctxn1Q8K129 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ctxn1Q8K129 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Ctxn1Q8K129 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ctxn1Q8K129 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ctxn1Q8K129 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ctxn1Q8K129 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ctxn1Q8K129 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ctxn1Q8K129 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ctxn1Q8K129 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ctxn1Q8K129 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ctxn1Q8K129 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ctxn1Q8K129 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ctxn1Q8K129 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ctxn1Q8K129 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ctxn1Q8K129 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Ctxn1Q8K129 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ctxn1Q8K129 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ctxn1Q8K129 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ctxn1Q8K129 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ctxn1Q8K129 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ctxn1Q8K129 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ctxn1Q8K129 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ctxn1Q8K129 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ctxn1Q8K129 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ctxn1Q8K129 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ctxn1Q8K129 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ctxn1Q8K129 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ctxn1Q8K129 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ctxn1Q8K129 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ctxn1Q8K129 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ctxn1Q8K129 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ctxn1Q8K129 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ctxn1Q8K129 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
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