Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ctxn1Q8K129 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ctxn1Q8K129 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ctxn1Q8K129 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ctxn1Q8K129 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ctxn1Q8K129 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ctxn1Q8K129 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ctxn1Q8K129 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ctxn1Q8K129 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ctxn1Q8K129 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ctxn1Q8K129 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ctxn1Q8K129 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctxn1Q8K129 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctxn1Q8K129 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctxn1Q8K129 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ctxn1Q8K129 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ctxn1Q8K129 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ctxn1Q8K129 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctxn1Q8K129 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctxn1Q8K129 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctxn1Q8K129 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctxn1Q8K129 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctxn1Q8K129 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctxn1Q8K129 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ctxn1Q8K129 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ctxn1Q8K129 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctxn1Q8K129 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ctxn1Q8K129 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctxn1Q8K129 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctxn1Q8K129 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ctxn1Q8K129 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctxn1Q8K129 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ctxn1Q8K129 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ctxn1Q8K129 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ctxn1Q8K129 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctxn1Q8K129 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctxn1Q8K129 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctxn1Q8K129 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctxn1Q8K129 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctxn1Q8K129 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctxn1Q8K129 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1Q8K129 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1Q8K129 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctxn1Q8K129 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctxn1Q8K129 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ctxn1Q8K129 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctxn1Q8K129 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctxn1Q8K129 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctxn1Q8K129 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctxn1Q8K129 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctxn1Q8K129 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctxn1Q8K129 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctxn1Q8K129 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctxn1Q8K129 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctxn1Q8K129 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctxn1Q8K129 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctxn1Q8K129 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctxn1Q8K129 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctxn1Q8K129 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctxn1Q8K129 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctxn1Q8K129 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctxn1Q8K129 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctxn1Q8K129 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctxn1Q8K129 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctxn1Q8K129 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctxn1Q8K129 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctxn1Q8K129 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctxn1Q8K129 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctxn1Q8K129 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctxn1Q8K129 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctxn1Q8K129 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctxn1Q8K129 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctxn1Q8K129 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctxn1Q8K129 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctxn1Q8K129 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctxn1Q8K129 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctxn1Q8K129 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctxn1Q8K129 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctxn1Q8K129 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctxn1Q8K129 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctxn1Q8K129 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1Q8K129 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ctxn1Q8K129 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctxn1Q8K129 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctxn1Q8K129 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctxn1Q8K129 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctxn1Q8K129 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctxn1Q8K129 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctxn1Q8K129 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctxn1Q8K129 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctxn1Q8K129 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctxn1Q8K129 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctxn1Q8K129 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctxn1Q8K129 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctxn1Q8K129 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctxn1Q8K129 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctxn1Q8K129 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctxn1Q8K129 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctxn1Q8K129 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctxn1Q8K129 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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