RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcsk2P21661 637 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uck1P52623 277 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps3aP97351 264 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3gnt4Q1RLK6 350 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cnpy1Q4VAB4 94 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smad2Q62432 467 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc6a5Q761V0 799 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cxcl16Q8BSU2 246 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Steap3Q8CI59 488 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr583Q8VG25 319 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clec2fQ8VI21 196 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrch4Q921G6 680 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl43Q99N89 183 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Izumo2Q9DA16 220 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nr4a3Q9QZB6 627 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm28557A0A087WQQ0 336 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc9a6A1L3P4 702 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BC035947B2RQY6 695 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TmppeD3Z286 447 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam46aD3Z5S8 447 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc10a1O08705 362 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galr3O88853 370 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P03987 398 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MbpP04370 250 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klk1b9P15949 261 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FurinP23188 793 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd63P41731 238 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wnt11P48615 354 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sox3P53784 375 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nell1Q2VWQ2 810 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FuzQ3UYI6 415 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr12Q60894 333 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AstlQ6HA09 435 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serinc5Q8BHJ6 461 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mal2Q8BI08 175 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tctn1Q8BZ64 593 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ston1Q8CDJ8 730 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cox10Q8CFY5 443 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc23Q8CHY7 488 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gbgt1Q8VI38 347 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BniplQ99JU7 328 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sucnr1Q99MT6 317 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smurf1Q9CUN6 731 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc10a6Q9CXB2 373 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cthrc1Q9D1D6 245 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prss52Q9D9M0 321 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phyhd1Q9DB26 291 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hipk2Q9QZR5 1196 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scnn1gQ9WU39 655 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atg2bQ80XK6 2075 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PvrigA0A1B0GS01 234 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr619E9PV95 320 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp870J3QMA4 560 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Opn1mwO35599 359 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TtlP38585 377 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Etv1P41164 477 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SmsP97355 366 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tgtp2Q3T9E4 415 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tgtp1Q62293 415 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ift52Q62559 426 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Frg2f1Q6P3A2 227 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bend6Q6PFX2 281 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 F12Q80YC5 597 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pomgnt2Q8BW41 605 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam4Q8CGQ2 763 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mchr1Q8JZL2 353 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Alkbh3Q8K1E6 286 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GaleQ8R059 347 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1284Q8VF29 311 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr308Q8VFP2 308 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr791Q8VGJ0 312 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc7a13Q91WN3 478 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ferd3lQ923Z4 168 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Etv5Q9CXC9 510 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PaicsQ9DCL9 425 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acot2Q9QYR9 453 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Minpp1Q9Z2L6 481 aa9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv12-38A0A0G2JEI7 115 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem74bA2AU34 232 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas2r122D3YU55 309 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r109K7N747 858 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccrl2O35457 360 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clk4O35493 481 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GcatO88986 416 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ly6fP35460 134 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd38P56528 304 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MlanaQ2TA50 113 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FcamrQ2TB54 535 aa9.52□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nutm2Q3V0C3 733 aa9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.4 ms