RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SGCD	Q92629	289 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PGM2	Q96G03	612 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	KRT12	Q99456	494 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	VAT1	Q99536	393 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CITED1	Q99966	193 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768		H0YGG7	62 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	OR2J2	O76002	312 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	RCBTB2	O95199	551 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	TGM6	O95932	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	BCL10	O95999	233 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	EPO	P01588	193 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CSF3	P09919	207 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC175	P0C221	793 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	NPPB	P16860	134 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CA4	P22748	312 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PSMA3	P25788	255 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	GDF1	P27539	372 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PSMB5	P28074	263 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PCGF2	P35227	344 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	HMGCL	P35914	325 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	KCNJ1	P48048	391 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PDLIM4	P50479	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	RASSF2	P50749	326 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	CDH15	P55291	814 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SNX1	Q13596	522 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	RCAN2	Q14206	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PTGR1	Q14914	329 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	NPAS1	Q99742	590 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	DRC3	Q9H069	523 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MLH1-223	ENST00000616768	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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