RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBXN1	Q04323	297 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GBX1	Q14549	363 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRPSAP1	Q14558	356 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCNJ11	Q14654	390 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MORF4L2	Q15014	288 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TDRP	Q86YL5	185 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RFX6	Q8HWS3	928 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR4L1	Q8NH43	312 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DOK4	Q8TEW6	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRRC45	Q96CN5	670 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NODAL	Q96S42	347 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SYT11	Q9BT88	431 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSPY26P	Q9H489	355 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF487	B1APH4	448 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WNT9B	O14905	357 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPANK1	O95872	356 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SERPINA6	P08185	405 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC35E2	P0CK97	266 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNNT1	P13805	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSMA3	P25788	255 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CNTF	P26441	200 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ABCD3	P28288	659 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MTNR1A	P48039	350 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NR2C2	P49116	596 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TAS2R40	P59535	323 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNFRSF17	Q02223	184 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLAMF1	Q13291	335 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SEMA3A	Q14563	771 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CARM1	Q86X55	608 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52N5	Q8NH56	324 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC01006	Q8NI28	216 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM136A	Q96C01	138 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AICDA	Q9GZX7	198 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZBTB14	O43829	449 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	REM1	O75628	298 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AIFM1	O95831	613 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SFTPB	P07988	381 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NPPB	P16860	134 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF17	P17021	662 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NAGA	P17050	411 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HK1	P19367	917 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCND1	P24385	295 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CTNNA2	P26232	953 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSMB4	P28070	264 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TTPA	P49638	278 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HMGCS1	Q01581	520 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NAE1	Q13564	534 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STX1A	Q16623	288 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q6ZT83	130 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF534	Q76KX8	674 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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