RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 LZICQ8WZA0 190 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ABHD17AQ96GS6 310 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PROK2Q9HC23 129 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 BAG5Q9UL15 447 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SUV39H1O43463 412 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX4O95219 450 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 OPN1SWP03999 348 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 P04436 131 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00303Q3SY05 128 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ZADH2Q8N4Q0 377 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SMYD1Q8NB12 490 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CRELD1Q96HD1 420 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 NDUFB5O43674 189 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ANGPTL1O95841 491 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 F10P00742 488 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CD46P15529 392 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 RHDQ02161 417 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 C17orf67Q0P5P2 114 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CD226Q15762 336 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 MARCH3Q86UD3 253 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF614Q8N883 585 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SCMH1Q96GD3 660 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 LRGUKQ96M69 825 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 DOHHQ9BU89 302 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 WIF1Q9Y5W5 379 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CLDN24A6NM45 220 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 NME2P1O60361 137 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TPST1O60507 370 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 LGI1O95970 557 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CSTAP01040 98 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SP1P08047 785 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 NME2P22392 152 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PLAURQ03405 335 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNAB2Q13303 367 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 BICRALQ6AI39 1079 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 EPPINO95925 133 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PDGFAP04085 211 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 FESP07332 822 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 UBL4AP11441 157 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CNR1P21554 472 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ACTR3P61158 418 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF20Q5VT98 475 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 RLIMQ9NVW2 624 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF264O43296 627 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SCO2O43819 266 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF682O95780 498 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZS92 163 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PACS2Q86VP3 889 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 COMTD1Q86VU5 262 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PROX1Q92786 737 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PYURFQ96I23 114 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 C5orf34Q96MH7 638 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKD3O94806 890 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 UMPSP11172 480 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 MSX1P28360 303 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 CD97P48960 835 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 SKP2Q13309 424 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-205ENST00000528462 NRF1Q16656 503 aa20.09■□□□□ 0.81
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