RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487698.5

SF3B1-211, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 2,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-211ENST00000487698 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.7□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ZAR1LA6NP61 321 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 NTN1O95631 604 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 OSMP13725 252 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ITIH1P19827 911 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CHMP24386 653 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 LCN1P31025 176 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 HLCSP50747 726 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CRISP1P54107 249 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CDH15P55291 814 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TUBA4AP68366 448 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 E2F1Q01094 437 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CDK5R2Q13319 367 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 OR1Q1Q15612 314 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CSRP2Q16527 193 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ZNF614Q8N883 585 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CDC6Q99741 560 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 GPA33Q99795 319 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ZNF559Q9BR84 538 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SDK2Q58EX2 2172 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 A0A0B4J2E0 115 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 A0A1B0GX12 115 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SERINC4A6NH21 518 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SLC1A7O00341 560 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 KLF4O43474 513 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TSPAN2O60636 221 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ATP6V1B1P15313 513 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ETV5P41161 510 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 OMPP47874 163 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 RNF4P78317 190 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 IL5RAQ01344 420 aa8.69□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 ISXQ2M1V0 245 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ZNF613Q6PF04 617 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 SLC34A3Q8N130 599 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 AMER2Q8N7J2 671 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 APH1BQ8WW43 257 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 STRADBQ9C0K7 418 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.69□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.68□□□□□ -1.02
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SF3B1-211ENST00000487698 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 C4orf47A7E2U8 309 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ABCB7O75027 752 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 LRP3O75074 770 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 UTS2O95399 124 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CCDC159P0C7I6 412 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 GABRB1P18505 474 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 TBXA2RP21731 343 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 GSSP48637 474 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 NR1H2P55055 460 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CXCR4P61073 352 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.68□□□□□ -1.02
SF3B1-211ENST00000487698 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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