RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ACY1Q03154 408 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB11BQ15907 218 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SYT4Q9H2B2 425 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGB4P16144 1822 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 EVPLQ92817 2033 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CIB4A0PJX0 185 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FUOMA2VDF0 154 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RAD51DO75771 328 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 P04436 131 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CD3GP09693 182 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP24386 653 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC5A2P31639 672 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 UGT2B10P36537 528 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ACTR6Q9GZN1 396 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 F5H0A9 414 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PTTG1O95997 202 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 BORCS8Q96FH0 119 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP50Q9UKX7 468 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PNMTP11086 282 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 AMY2BP19961 511 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB40BQ12829 278 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PELI3Q8N2H9 469 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CACNA1CQ13936 2221 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMA4Q16363 1823 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PITPNBP48739 271 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PTH2RP49190 550 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NKX3-2P78367 333 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNJ10P78508 379 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF91Q05481 1191 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ASB15Q8WXK1 588 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL6Q9H0F7 186 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP205Q92621 2012 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CACNG3O60359 315 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNK5O95279 499 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 UBL4AP11441 157 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SQSTM1Q13501 440 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC58Q4VC31 144 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 WBP2Q969T9 261 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 C7orf34Q96L11 122 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NOTOA8MTQ0 251 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 LYRM1O43325 122 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OPN1LWP04000 364 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR137CQ8N3F9 429 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF611Q8N823 705 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL15Q96M94 604 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 KATNBL1Q9H079 304 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FAIMQ9NVQ4 179 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PHYHO14832 338 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GASTP01350 101 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 IRS1P35568 1242 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1D4P47884 311 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 DAPP51397 102 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SSX6Q7RTT6 188 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FURINP09958 794 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SPCS2Q15005 226 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NHSL2Q5HYW2 709 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 UEVLDQ8IX04 471 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GVG6 124 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms