RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Speer4eK7N6S8 255 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtpbp1O08582 668 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PlauP06869 433 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AmbpQ07456 349 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfsd2bQ3T9M1 494 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trappc13Q3TIR1 417 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taar2Q5QD17 339 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1045Q7TR80 315 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nars2Q8BGV0 477 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Baiap2Q8BKX1 535 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr853Q8VGG6 305 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl19Q9D338 292 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hipk2Q9QZR5 1196 aa15.1■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif26aQ52KG5 1881 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd16E9Q173 522 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nid1P10493 1245 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf149Q3U2C5 394 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P4ha2Q60716 537 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OgnQ62000 298 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glt8d2Q640P4 349 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt8Q64676 541 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alkbh2Q6P6J4 239 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgl1Q71KU9 314 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rspo2Q8BFU0 243 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C8bQ8BH35 589 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EfhbQ8CDU5 853 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rfwd3Q8CIK8 774 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FgbQ8K0E8 481 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem17Q8K0U3 198 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmcc3Q8R310 477 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr643Q8VGY1 314 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col26a1Q91VF6 440 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr459Q924H8 314 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stra6lQ9DBN1 621 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr137cE9Q343 423 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr746E9Q840 314 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8220F6YKI2 213 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cntn1P12960 1020 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taar7fQ5QD08 358 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr12Q60894 333 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Enpp3Q6DYE8 874 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tvp23aQ6NVH0 222 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RfkQ8CFV9 155 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb16Q8VHS5 453 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sp6Q9ESX2 376 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srd5a3Q9WUP4 330 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btg4O70552 250 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elk1P41969 429 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep76Q0VEJ0 659 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epha1Q60750 977 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timm22Q9CQ85 194 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chmp1b2Q9CQD4 199 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capns2Q9D7J7 247 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Izumo2Q9DA16 220 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alg5Q9DB25 324 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Khdrbs2Q9WU01 349 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtgfrnQ9WV91 879 aa15.09■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm11127A7VMS2 374 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r98E9PZ56 857 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp974Q3UVF6 752 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gper1Q8BMP4 375 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mnd1Q8K396 205 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb18Q8VHA6 467 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrch4Q921G6 680 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dll4Q9JI71 686 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xpr1Q9Z0U0 695 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps13aQ5H8C4 3166 aa15.08■□□□□ 0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29776A0A286YEC0 699 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxa4P06798 285 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GypaP14220 168 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UbqlnlQ14DL0 610 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgap2Q3TQR0 254 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gal3st4Q3V1B8 480 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SypQ62277 314 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrlhrQ6VMN6 370 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pafah2Q8VDG7 390 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcyt2Q922E4 404 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TMEM121BQ99MX7 572 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rsph9Q9D9V4 276 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aif1lQ9EQX4 150 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cytl1A1E5L0 139 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms