Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Elk1P41969 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Elk1P41969 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Elk1P41969 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Elk1P41969 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Elk1P41969 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Elk1P41969 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Elk1P41969 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Elk1P41969 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Elk1P41969 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Elk1P41969 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elk1P41969 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Elk1P41969 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Elk1P41969 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Elk1P41969 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Elk1P41969 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elk1P41969 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Elk1P41969 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Elk1P41969 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Elk1P41969 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Elk1P41969 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Elk1P41969 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Elk1P41969 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Elk1P41969 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Elk1P41969 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Elk1P41969 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Elk1P41969 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Elk1P41969 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Elk1P41969 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Elk1P41969 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Elk1P41969 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Elk1P41969 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Elk1P41969 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Elk1P41969 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Elk1P41969 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Elk1P41969 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Elk1P41969 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Elk1P41969 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Elk1P41969 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Elk1P41969 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Elk1P41969 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Elk1P41969 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Elk1P41969 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Elk1P41969 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Elk1P41969 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Elk1P41969 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Elk1P41969 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Elk1P41969 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Elk1P41969 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Elk1P41969 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Elk1P41969 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Elk1P41969 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Elk1P41969 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Elk1P41969 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Elk1P41969 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Elk1P41969 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Elk1P41969 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Elk1P41969 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Elk1P41969 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Elk1P41969 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Elk1P41969 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Elk1P41969 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Elk1P41969 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Elk1P41969 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Elk1P41969 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Elk1P41969 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elk1P41969 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Elk1P41969 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Elk1P41969 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Elk1P41969 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Elk1P41969 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elk1P41969 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elk1P41969 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Elk1P41969 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Elk1P41969 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Elk1P41969 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Elk1P41969 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Elk1P41969 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Elk1P41969 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Elk1P41969 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Elk1P41969 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Elk1P41969 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Elk1P41969 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Elk1P41969 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elk1P41969 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Elk1P41969 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elk1P41969 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elk1P41969 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elk1P41969 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elk1P41969 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elk1P41969 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elk1P41969 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Elk1P41969 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elk1P41969 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elk1P41969 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elk1P41969 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elk1P41969 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elk1P41969 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elk1P41969 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elk1P41969 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms