RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 CLCF1Q9UBD9 225 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHGB4Q9UN71 923 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-211ENST00000609454 ALG1L2C9J202 215 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SOX30O94993 753 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 C6orf47O95873 294 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 TBXA2RP21731 343 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CPOXP36551 454 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 B3GALT5-AS1P59052 145 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CCNJQ5T5M9 372 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 POMZP3Q6PJE2 187 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 MISPQ8IVT2 679 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF527Q8NB42 609 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 OR4C3Q8NH37 302 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC01560Q8TB33 94 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 MOAP1Q96BY2 351 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 STACQ99469 402 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 DUSP26Q9BV47 211 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ACTRT3Q9BYD9 372 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 NEUROD4Q9HD90 331 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PACSIN3Q9UKS6 424 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 RAP2CQ9Y3L5 183 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 AP4B1Q9Y6B7 739 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A087WZY1 265 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 A6NNC1 897 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 H3BNH8 94 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CASKO14936 926 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ITM2AO43736 263 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 TNFRSF21O75509 655 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CTAG2O75638 210 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 NUDT14O95848 222 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 TGM6O95932 706 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 G6PDP11413 515 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 EPXP11678 715 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ME2P23368 584 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ARRB2P32121 409 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K8P41279 467 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC1A6P48664 564 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SORDQ00796 357 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 EMX2Q04743 252 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 STX3Q13277 289 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 HHATQ5VTY9 493 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 APOOLQ6UXV4 268 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF781Q8N8C0 355 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CDS1Q92903 461 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ZIM3Q96PE6 472 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PIGUQ9H490 435 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 DUSP22Q9NRW4 184 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 RASSF1Q9NS23 344 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 NDRG3Q9UGV2 375 aa17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1W2PNV4 684 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ESPNB1AK53 854 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 B4DXG7 233 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 HCRTR2O43614 444 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CRHP06850 196 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 NGFRP08138 427 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNJ5P48544 419 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 RPL14P50914 215 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CLDN15P56746 228 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SIRPAP78324 504 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SMU1Q2TAY7 513 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC73Q6P1J9 531 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF614Q8N883 585 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 VPS37AQ8NEZ2 397 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 OR5AK3PQ8NH89 298 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM110BQ8TC76 370 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 COQ8BQ96D53 544 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 DPY30Q9C005 99 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXD1Q9GZZ0 328 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CXorf36Q9H7Y0 433 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 GIN1Q9NXP7 522 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 GALNT8Q9NY28 637 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 RAB21Q9UL25 225 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PDZD2O15018 2839 aa17.31■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SHISA8B8ZZ34 492 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PLGP00747 810 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 BGNP21810 368 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ART1P52961 327 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CLDN8P56748 225 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 CLDN20P56880 219 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PON3Q15166 354 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 PDSS1Q5T2R2 415 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 SFXN5Q8TD22 340 aa17.3■□□□□ 0.36
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB8AQ96BR9 441 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms