RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 FPR2P25090 351 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GIFP27352 417 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GABRB3P28472 473 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GGT5P36269 586 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 EMDP50402 254 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SLC12A2P55011 1212 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CORO7P57737 925 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RAB10P61026 200 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CRYMQ14894 314 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 FCRLAQ7L513 359 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GALNT7Q86SF2 657 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 VSTM4Q8IW00 320 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SLC43A2Q8N370 569 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 OR51F2Q8NH61 342 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 EXT2Q93063 718 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 KLHL29Q96CT2 875 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ADGRG7Q96K78 797 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SENP1Q9P0U3 644 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 NTMQ9P121 344 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS50Q9UI38 385 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF639Q9UID6 485 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0J9YW62 118 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PR80 420 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf226A1L170 272 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GJE1A6NN92 205 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 B9A039 149 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 M0QZ24 198 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 NUDT17P0C025 328 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MTHFD2P13995 350 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PCSK2P16519 638 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PGCP20142 388 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV1-2P23083 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SFTPDP35247 375 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 BSGP35613 385 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 OR3A2P47893 321 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RFX3P48380 749 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GPX6P59796 221 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CUL3Q13618 768 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MARCH3Q86UD3 253 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RNF214Q8ND24 703 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RNF138Q8WVD3 245 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SLC9A6Q92581 669 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CERS2Q96G23 380 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RNF145Q96MT1 663 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 OPTCQ9UBM4 332 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PGM3O95394 542 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ANGPTL1O95841 491 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CT45A8P0DMV1 189 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CT45A9P0DMV2 189 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 COX5AP20674 150 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GCH1P30793 250 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SERPINF1P36955 418 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MAGEA6P43360 314 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 KCNJ1P48048 391 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PPOXP50336 477 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MAPK12P53778 367 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF460Q14592 562 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TRIP10Q15642 601 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 LTB4RQ15722 352 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 DECR1Q16698 335 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 C1QL4Q86Z23 238 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 LILRA2Q8N149 483 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms