RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SOD1P00441 154 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 IGHV2-5P01817 119 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MT-ND4LP03901 98 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CRYBA1P05813 215 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MMP3P08254 477 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CKBP12277 381 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CXCL3P19876 107 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SAT1P21673 171 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PRPH2P23942 346 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ADRA1AP35348 466 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ARL2P36404 184 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PTGFRP43088 359 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HTR5AP47898 357 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ARFIP1P53367 373 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HCCSP53701 268 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DLX5P56178 289 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 WNT4P56705 351 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CLDN8P56748 225 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C21orf58P58505 322 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RAB1AP62820 205 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ERVK-25P63136 954 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ACVR1Q04771 509 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BIKQ13323 160 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.347e-9■□□□□ 8.7
PKP4-211ENST00000481115 PMS2P11Q13670 270 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 COTL1Q14019 142 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HBMQ6B0K9 141 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FDX2Q6P4F2 183 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 VITQ6UXI7 678 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZSR9 355 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMUB2Q71RG4 321 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 METTL23Q86XA0 190 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 STK40Q8N2I9 435 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PGBD5Q8N414 524 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LINC00471Q8N535 108 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C7orf31Q8N865 590 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RNF152Q8N8N0 203 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BEST4Q8NFU0 473 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 METTL6Q8TCB7 284 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SPATA33Q96N06 139 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DEFB118Q96PH6 123 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GPR20Q99678 358 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DPY30Q9C005 99 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ACTL8Q9H568 366 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 XKR8Q9H6D3 395 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ALG9Q9H6U8 611 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 WDR26Q9H7D7 661 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NUDT15Q9NV35 164 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PCTPQ9UKL6 214 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NEU3Q9UQ49 428 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MYLKQ15746 1914 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR6C74A6NCV1 312 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 H7C0S8 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GFYI3L273 518 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF11BO00300 401 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RECQL4O94761 1208 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 UBL3O95164 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RAB36O95755 333 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PEX11BO96011 259 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ADAP00813 363 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TFP02787 698 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SERPIND1P05546 499 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FHP07954 510 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SPARCP09486 303 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GKN3PP0CG01 181 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ABOP16442 354 aa6.7□□□□□ -1.34
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