RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ELP5Q8TE02 316 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TMCO6Q96DC7 493 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MPP4Q96JB8 637 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MCHR1Q99705 422 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MMP25Q9NPA2 562 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TCFL5Q9UL49 500 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.87□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf72A4D263 438 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SERINC4A6NH21 518 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 EI24O14681 340 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SLC30A4O14863 429 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TNFSF15O95150 251 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 UMODP07911 640 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 GSTM3P21266 225 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CAPGP40121 348 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CDH12P55289 794 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TAS2R41P59536 307 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 COPZ1P61923 177 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ESRRGP62508 458 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SLC36A3Q495N2 470 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CCNJQ5T5M9 372 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 RAB43Q86YS6 212 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CDK20Q8IZL9 346 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PARP8Q8N3A8 854 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DOK4Q8TEW6 326 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.86□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SELENONQ9NZV5 590 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MYOTQ9UBF9 498 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.86□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 USP34Q70CQ2 3546 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 UTS2O95399 124 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 HPP00738 406 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 MSX1P28360 303 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 EFNA3P52797 238 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 SNTA1Q13424 505 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DNASE1L3Q13609 305 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PCOLCEQ15113 449 aa8.85□□□□□ -0.99
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